Posteriormente, y dado que el paso del tren por plena calle Aldunate producía contaminación, como los reclamos de los comerciantes, los cuales tenían que limpiar, a cada paso del tren, los escaparates, las chispas que provocaban incendios, los profesores, quienes reclamaban que no dejaban hacer clases y accidentes, se procedió a levantar el tendido de los rieles alrededor del año 1952. El sistema de transporte fue reemplazado por modernos buses para el transporte colectivo de pasajeros. Las instalaciones de maestranza y estaciones fueron reubicadas en lugares alejados del centro de la ciudad, en lo que hoy es Porvenir y Covico. En información aparecida en el Diario El regional de Coquimbo, con fecha 8 de enero de 1951, se da cuenta de que una de las causas principales de los accidentes lo constituía el apozamiento de agua entre los rieles, que a su vez se transformaba en barro que impedía una circulación expedita de los peatones, produciéndose muchos atropellos.